war das MP-E 65 auf 5:1 eingestellt? Ein 100%Crop von Wolle bei 5:1 müßte eigentlich größer sein.
Vor allem sollten die Vergleichsbilder auf jeden Fall unbearbeitet sein!
Nimm mal ein Seidentuch, lege es auf einen schrägen Untergrund (damit der Tiefenschärfeverlauf auch sichtbar wird) , stell das MP-E auf 5:1 und mach den Versuch nocheinmal. Vielleicht ist Dein MP-E ja ein optisches Phänomen

Hier ist noch ein Link zu einem sehr ausführlichen Erfahrungsbericht (englisch), der zu dem gleichen Ergebnis wie ich hinsichtlich der Beugungsunschärfe kommt: http://www.waynesthisandthat.com/macro.html
Gruß
Knut